两性霉素B的用药方式有静脉用药、鞘内用药、局部用药等。静脉用药时需选择静脉滴注的方式，给药时先按照1~5mg或0.02~0.1mg/kg体重的剂量使用，然后再根据患者的药物耐受情况，每日或隔日增加用药5mg。当药量增至0.6~0.7mg/kg一次的时候需要暂停增加药量。不建议自行用药，建议到医院面诊后，遵医嘱使用，才能达到良好的治疗效果。
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